全基因组芯片结合通路分析筛选心力衰竭患者心肌细胞差异基因

吴晓霞; 万涛; 吴红金; 智光; 肖苍松; 高长青; 吴加金

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全基因组芯片结合通路分析筛选心力衰竭患者心肌细胞差异基因

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目的利用人全基因组芯片分析心力衰竭（心衰）患者与正常人心肌细胞差异表达基因,结合已知基因功能分类着重对细胞信号通路进行分析。方法应用华联公司人全基因组芯片,检测4例心衰患者及4例脑死亡的正常人心肌细胞的基因表达谱,并以实时荧光定量 PCR 技术对基因芯片检测结果进行验证。将心衰差异表达量≥1.2倍或≤-1.2倍的基因经 BioCarta 通路和 KEGG通路进行信号通路分析。结果 4例心衰心肌标本与正常对照比较,表达量变化1.2倍以上的基因有2806条;变化2倍以上的有399条基因。经 BioCarta 通路分析,心衰时涉及11条通路蛋白。经KEGG 通路分析,涉及16条通路。结论心衰时心肌细胞中有大量的基因呈现差异表达,并激活了多条促进细胞凋亡通路及涉及转录调控的通路。运用基因芯片和生物学通路相结合的方法,分析基因表达谱能准确而且有的放矢地研究与心衰病理生理的相关基因。

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来源
《中华心血管病杂志》 |2009年第2期||共页
作者
吴晓霞; 万涛; 吴红金; 智光; 肖苍松; 高长青; 吴加金;
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作者单位

1. 武警总医院心内科 2. 解放军总医院肝胆外科 3. 北京市中西医结合医院 4. 解放军总医院心内科 5. 解放军总医院心外科 6. 军事医学科学院基础医学研究所;

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正文语种 chi
中图分类筋腱、韧带、滑囊疾病及损伤;
关键词
心力衰竭; 充血性; 基因表达; 信号传导;

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