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乙型肝炎病毒Y(I/V)DD变异模式与基因型关系的分析

         

摘要

目的分析HBV反转录酶区rtM204位点Y(I/V)DD变异及其模式与基因型、亚型的相关性。方法用MEGA4软件对来自基因库/欧洲分子生物学实验室/日本DNA数据库的2849株人类HBV全基因序列进行精准分型,反转录酶区氨基酸对齐排列,统计各位点变异频数。用非参数检验分析变异类别、模式与基因型的关系。结果 Y(I/V)DD变异毒株共217株,15种变异模式。其中YIDD变异120株,12种变异模式,其基因型分布为:A型(2株)、B型(B2亚型19株)、C型(C1亚型1株、C2亚型78株和C5亚型1株)、D型(17株)、E型(1株)、G型(1株);YVDD变异97株,9种变异模式,其基因型分布为:A型(17株)、B型(B2亚型22株)、C型(C1亚型3株和C2亚型48株)、D型(3株)、G型(3株)、H型(1株)。Y(I/V)DD在基因型A~D型(x~2=25.558,P<0.01)、A~C型(x~2=17.814,P<0.01)及A与B型(x~2=7.198,P<0.01)分布差异均有统计学意义。Y(I/V)DD在基因型B~D型(x~2=8.430,P<0.05)及C与D型(x~2=8.430,P<0.05)分布差异均有统计学意义。Y(I/V)DD在基因型B与C型(x~2=2.756,P=0.10)分布差异无统计学意义。YIDD主要变异模式在基因型A~D型(x~2=0.832,P=0.87)及B2与C2亚型(x~2=1.928,P=0.75)分布差异均无统计学意义;YVDD主要变异模式在基因型A~D型(x~2=16.447,P<0.01)分布差异有统计学意义,其中rtM204V-rtL180M和rtM204V-rtL180M-rtV173L模式在B2~C2亚型(x~2=9.531,P<0.01)分布差异有统计学意义。发生YVDD变异时,B2亚型以rtM204V-rtL180M模式为主,rtM204V-rtL180M-rtVl73L具有C2亚型高度选择性。结论 Y(I/V)DD变异及其模式具有基因型选择性倾向,C2亚型Y(I/V)DD模式比其他基因型更具多样性、独特性和复杂性。

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