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鲍曼不动杆菌多重耐药中国分离株的多位点序列分型及种群结构

         

摘要

目的了解中国鲍曼不动杆菌多重耐药株的遗传背景,并分析鲍曼不动杆菌的种群结构。方法采用多位点序列分型(MLST)分析了33株来自中国的鲍曼不动杆菌多重耐药株,并汇总MLST数据库中该菌的相关数据,鉴定了序列型与克隆群,分析了各个看家基因是否存在同源重组,计算了总体种群的标准化关联系数(IS A)、重组与突变比值。针对MLST数据库中所有423株菌的等位基因型图谱,构建了种群系统发育树。结果 33株菌中有6个序列型,其中29株属于CC92克隆群。所有7个看家基因中(gltA、gyrB、recA、cpn60、gdhB、gpi、rpoD),后3个位点发生了统计学意义上的重组。总体种群的重组及突变比值为6.083,IS A值为0.155。所有纳入分析的423株菌可分为224个序列型,共鉴定出10个克隆群,其中CC92是主导克隆群。423株菌的系统进化树较好地呈现各序列型之间的进化关系,直观地展示了鲍曼不动杆菌的微进化。结论 33株鲍曼不动杆菌多重耐药株大多属于CC92克隆群。鲍曼不动杆菌的种群内存在频繁重组,但等位基因型仍保持着连锁不平衡的特征,该菌具有典型的Epidemic种群结构。

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