番鸭呼肠孤病毒非结构基因的克隆和序列分析

张云; 欧阳岁东; 刘明; 胡奇林; 郎景华; 童光志

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番鸭呼肠孤病毒非结构基因的克隆和序列分析

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参考GenBank禽呼肠孤病毒(Avian Reovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒(Muscovy Duck Reovirus,MDRV)非结构基因(NS)序列设计合成一对引物,对番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因进行RT-PCR扩增,克隆到pMD18-T载体中,并对克隆产物进行酶切鉴定和测序;番鸭呼肠孤病毒NS基因由1 291 bp核苷酸组成,与禽呼肠孤病毒NS基因相比,在非编码区第1155位少一个碱基,本文第一次证实1291bp是番鸭呼肠孤病毒NS基因特有的长度;番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因的5'末端和3'末端分别为5‘GCTTTT和TCATC-3',是禽类呼肠孤病毒基因末端特有的碱基序列,S14和C4株NS基因的的有效阅读框(24～1127bp)编码367个氨基酸组成的蛋白,分子量约为40kDa;番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS蛋白等电点分别是7.3和7.0,GC含量分别为54.26%和53.71%,番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因间核苷酸同源性为99.3%,仅有4个氨基酸差异,S14和C4与法国番鸭呼肠孤病毒89026株NS基因核苷酸同源性分别为87.8%和87.9%,与鸡关节炎病毒S1133 NS基因同源性分别为79.0%和79.3%;进化树分析表明本研究中的两株番鸭呼肠孤病毒非结构基因(NS)与番鸭呼肠孤病毒的亲缘关系比禽呼肠孤病毒近的多,建议番鸭呼肠孤病毒应归属为正呼肠孤病毒属第二个亚群中不同于禽和内尔森贝海湾呼肠病毒独立基因群.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2005年第2期|139-143|共5页
作者
张云; 欧阳岁东; 刘明; 胡奇林; 郎景华; 童光志;
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作者单位

中国农业科学院,哈尔滨兽医研究所,生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150001;

福建农科院牧医所,福建,福州,350003;

中国农业科学院,哈尔滨兽医研究所,生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150001;

福建农科院牧医所,福建,福州,350003;

哈尔滨市兽医卫生防疫站,黑龙江,哈尔滨,150001;

中国农业科学院,哈尔滨兽医研究所,生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨,150001;

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正文语种 chi
中图分类兼性厌氧杆菌;转化及克隆;
关键词
番鸭呼肠孤病毒; NS基因; 克隆; 序列分析;

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