混合感染番木瓜PRSV/PLDMV株系基因组全长cDNA的克隆和实时荧光定量PCR分析

刘芳; 庹德财; 沈文涛; 言普; 黎小瑛; 周鹏

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番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)与番木瓜畸形花叶病毒(Papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)存在混合感染的现象,近年来混合感染发病率逐年递增,是一种新的威胁番木瓜种植业的病毒病害.运用RT-PCR和RACE方法从混合感染样品中克隆获得2种病毒基因组全长cDNA,分别命名为PRSV-LM和PLDMV-LM,GenBank登录号分别为KT633943和KT633944,基因组序列大小分别为10 325、10 153 nt(不包括3'端的poly A).序列分析表明:PRSV-LM与单独感染样品中的PRSV海南分离物HN(GenBank登录号:EF183499)的核苷酸序列和氨基酸序列相似性最高,为94％;PLDMV-LM与单独感染样品中的PLDMV海南分离物Hainan-DF(GenBank登录号:JX974555)核苷酸和氨基酸序列相似性最高,分别高达99％和97％.进化树分析显示,PRSV-LM和PLDMV-LM分别与单独感染样品的PRSV和PLDMV海南分离物有共同的进化起源.进一步利用实时荧光定量PCR对混合感染样品的PRSV与PLDMV病毒积累量进行分析,结果表明,混合感染样品中PLDMV病毒积累量大约是PRSV含量的100倍.研究结果为进一步探究PRSV/PLDMV混合感染发病机制奠定基础.

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来源
《热带作物学报》 |2016年第4期|742-751|共10页
作者
刘芳; 庹德财; 沈文涛; 言普; 黎小瑛; 周鹏;
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作者单位

海南大学环境与植物保护学院,海南海口 570228;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

海南大学环境与植物保护学院,海南海口 570228;

中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类热带及亚热带果类病虫害;
关键词
混合感染; PRSV; PLDMV; 序列分析; 绝对定量;

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