巴西橡胶树TCTP基因结构分析及分子标记开发

邓治; 覃碧; 冯福应; 李德军

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巴西橡胶树TCTP基因结构分析及分子标记开发

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翻译控制肿瘤蛋白(translationally controlled tumour protein,TCTP)是生物体中一种普遍存在且高度保守的蛋白.作为一种多功能蛋白,TCTP在各种复杂的生命活动中发挥重要作用.本研究根据已知的HbTCTP cDNA序列设计引物,对PCR扩增产物测序获得HbTCTP基因组序列.比对HbTCTP基因组和cDNA序列发现HbTCTP由4个内含子和5个外显子组成,内含子与外显子剪接处符合GT/AG法则.根据HbTCTP序列及基因结构信息开发简单重复序列(SSR)和内含子长度多态性(ILP)标记,并在10个橡胶树品系中分析SSR和ILP标记多态性.结果表明,SSR和ILP标记在10个橡胶树品系中均出现多态性,多态性分别由SSR重复次数多少和内含子长短引起.%The translationally controlled tumour protein (TCTP)is a ubiquitous and highly conserved protein in all eukaryotic organisms. As a multi-functioning protein, TCTP carries out vital roles in various life processes. Based on the known cDNA sequence of HbTCTP, we designed the primers to amplify the genome of HbTCTP, and got the genomic sequence of HbTCTP by sequencing the PCR product in this research. The results from aligning genomic and cDNA sequence of HbTCTP showed that HbTCTP contained four introns and five exons, and all intron/exon boundaries were in accordance with the GT/AG rule. The SSR and ILP markers were developed according to the nucleotide sequences and gene structure of HbTCTP, and the polymorphisms of SSR and ILP markers were further detected among 10 Hevea clones. The results showed that the SSR and ILP markers indicated polymorphic among 10 Hevea clones, and the polymorphisms of SSR and ILP markers resulted from the repeat time of SSR and length of intron, respectively.

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来源
《热带作物学报》 |2012年第8期|1450-1455|共6页
作者
邓治; 覃碧; 冯福应; 李德军;
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作者单位

中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州 571737;

中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州 571737;

内蒙古农业大学生命科学学院,内蒙古呼和浩特010018;

中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州 571737;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类橡胶树;目的基因的获得;
关键词
巴西橡胶树; 翻译控制肿瘤蛋白; 内含子; 多态性; 简单重复序列; 内含子长度多态性;

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