辽宁地区猪瘟病毒流行株E2基因序列分析

葛宝伟; 张志; 李晓成; 于学武; 段亚良; 高丰

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辽宁地区猪瘟病毒流行株E2基因序列分析

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为了解近年来辽宁地区猪瘟流行毒株的遗传变异情况,本试验利用RT-PCR方法对2006年～2011年辽宁地区发病猪群中猪瘟病毒感染情况进行了检测并获得了20株猪瘟病毒E2基因部分编码序列的扩增片段,测序后得到276 bp的E2基因编码序列；并在此基础上利用DNAStar和MegAlign等软件对所测定的20株毒株与国内外参考毒株的相应序列进行了同源性分析及氨基酸序列比对.结果表明,20株猪瘟野毒株分别属于基因2.1、2.2亚型和1.1亚型,其中基因2.1亚型已经成为辽宁地区猪瘟病毒的优势流行毒株.属于基因2.1亚型的猪瘟野毒株与疫苗株之间的同源性在76.8％～80.5％之间,与经典强毒Shimen株的同源性在77.4％～81.1％之间.而病毒E2基因变异位点主要分布在所测序列的前30个氨基酸,与强毒Shimen株、疫苗株相比其变异率高达20％以上.说明近期流行毒株的变异呈现一定的多样性,并且多数毒株已向远离强毒Shimen株、疫苗株方向变异.

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来源
《中国兽医杂志》 |2012年第12期|6-10|共5页
作者
葛宝伟; 张志; 李晓成; 于学武; 段亚良; 高丰;
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作者单位

吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春130062;

辽宁省动物疫病预防控制中心,辽宁沈阳110164;

中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032;

中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032;

辽宁省动物疫病预防控制中心,辽宁沈阳110164;

辽宁省动物疫病预防控制中心,辽宁沈阳110164;

吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春130062;

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正文语种 chi
中图分类猪瘟病毒;
关键词
猪瘟病毒; E2基因; 序列分析;

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