烟草CYP71D亚家族的生物信息学分析

王蕾; 赵泽玉; 陈明丽; 龚达平

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烟草CYP71D亚家族的生物信息学分析

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cqvip:细胞色素P450(CYP450)是一类超基因家族编码的多功能氧化酶,在生物合成、代谢解毒及植物防御方面具有重要作用。其中CYP71D属于CYP450的一个亚家族,主要在次生代谢物合成和病虫害防御方面起作用。为了更好地了解烟草CYP71D亚家族基因特征和功能,本研究利用生物信息学分析手段及烟草转录组数据,对CYP71D亚家族基因的结构和表达等进行了分析。结果发现,在烟草中共有42个CYP71D亚家族成员,各成员在染色体上并非均匀分布,其氨基酸长度和等电点差异较大,但基因结构、保守结构域数目和分布高度一致;二级结构分析表明,烟草CYP71D亚家族成员具备P450蛋白特征结构域;基因表达模式分析显示,多数CYP71D基因在根、叶、花中特异表达,大部分基因参与了IAA激素、黑胫病、温度等逆境胁迫反应。这为烟草CYP71D亚家族基因功能的深入研究及烟草抗逆品种的培育奠定了基础。

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来源
《中国烟草科学》 |2020年第2期|79-8592|共8页
作者
王蕾; 赵泽玉; 陈明丽; 龚达平;
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作者单位

中国农业科学院烟草研究所青岛 266101;

中国农业科学院研究生院北京 100081;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
烟草; CYP71D亚家族; 生物信息学分析;

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