基于复杂性K近邻规则的蛋白质亚细胞位点预测

李斌; 李义兵; 何红波

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基于复杂性K近邻规则的蛋白质亚细胞位点预测

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提出了一个基于符号序列LZ复杂性相似度和K近邻规则的蛋白质亚细胞位点类型预测的方法.相比许多其他特征参数,蛋白质序列的LZ复杂性相似度计算无需深入的生物学领域知识和除序列数据以外的其他辅助数据.同时,K近邻规则的延迟学习特性适合于亚细胞位点类型已知的蛋白质数据的动态增加.在标准的RH数据集上对该预测方法进行10重交叉验证,其总体的预测准确率优于4种对照预测方法.

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来源
《计算机工程》 |2007年第7期|28-2932|共3页
作者
李斌; 李义兵; 何红波;
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作者单位

中南大学信息科学与工程学院;

长沙;

410083;

中南大学物理科学与技术学院;

长沙;

410083;

中南大学物理科学与技术学院;

长沙;

410083;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类自动推理、机器学习;
关键词
生物信息学; LZ复杂性相似度; K近邻; 蛋白质; 亚细胞位点;

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