15个短串联重复序列在河北部分地区汉族群体的遗传多态性分析

焦保权; 吴小华; 张洁

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目的：研究PowerplexTM 16荧光标记复合扩增系统的15个短串联重复序列（simple tandem repeats,STR）在河北中南部地区25 295例汉族个体的多态性分布,建立河北中南部地区汉族群体的遗传学基础数据。方法：采用Chelex-100法应用Powerplex TM 16荧光标记复合扩增系统和ABI 3130遗传分析仪对25 295例河北中南部地区汉族个体血样DNA进行检测,统计计算15个STR基因座的基因型分布,基因频率,杂合度（heterozygosity,Ho）,多态信息量（polymorphism information contents,PIC）,个体识别率（discrimination power,DP）,非父排除率（probability of paternity exclusion,PE）等群体遗传学参数,并进行Handy-Weinberg平衡检验。结果：15个基因座在群体中具有较高多态性,基因型分布均符合Handy-Weinberg平衡定律（P〉0.05）。共检测出293个等位基因,1364种基因型,基因频率在0.002%~51.58%之间,杂合度（Ho）在0.6206~0.9146之间,多态信息量（PIC）在0.5610~0.8967之间,累积个人识别率（cumulative individual discrimination power,CDP）为0.999 999 999 999 999 996 156,累积非父排除率（cumulative probability of paternity exclusion,CPE）为0.999 999 663。结论：Powerplex TM 16荧光标记复合扩增系统的15个STR基因座适合作为河北中南部汉族群体的遗传标记。通过大量样本实验,首次得到了客观可靠的河北中南部地区汉族群体15个STR基因座群体遗传资料,为遗传疾病连锁分析、法医学亲权鉴定和个体识别等领域研究提供基础数据。

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来源
《中国优生与遗传杂志》 |2016年第9期|8-10|共4页
作者
焦保权; 吴小华; 张洁;
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作者单位

白求恩国际和平医院妇产科生殖医学中心;

石家庄050081;

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正文语种 chi
中图分类 R394.5;
关键词
STR; 基因频率; 遗传标记; 多态性; 河北中南部;

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