两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

杨润婷; 吴波; 李翀; 曾培; 曾继吾; 钟云; 姜波; 周碧容; 钟广炎

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两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

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用两种常用的 SNP 分型方法,等位基因特异性 PCR 法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对 16 个柚栽培品种和 8 个柚杂种后代材料进行了 7 个 SNP 位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将 24 个样本分成了 22 种基因型。值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系。可见,AS-PCR 和 HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定。AS-PCR 法是一种准确、低成本的 SNP 分型方法,适合普通实验室使用,惟对 PCR 反应体系要求严格。HRMA 分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高。

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来源
《园艺学报》 |2013年第6期|1061-1070|共10页
作者
杨润婷; 吴波; 李翀; 曾培; 曾继吾; 钟云; 姜波; 周碧容; 钟广炎;
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作者单位

西南大学园艺园林学院;

重庆400715;

广东省农业科学院果树研究所;

农业部热带南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室;

广州510640;

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正文语种 chi
中图分类柑桔类;
关键词
柚; 单核苷酸多态性; 等位基因特异性PCR; 高分辨率熔解曲线分析; 基因分型;

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