目的利用已建立的整合酶晶体结构与整合酶抑制剂雷特格韦的分子对接模型,计算HIV-1整合酶突变蛋白体与雷特格韦之间分子自由能的改变,以此评估整合酶基因突变是否会造成针对雷特格韦的耐药性。方法本研究采用Discovery Studio 2.5软件模块的分子对接程序构建整合酶药物雷特格韦与整合酶核心区蛋白晶体结构(1BL3)的复合物模型,采用氨基酸突变的方式进入整合酶野生型蛋白突变体,计算整合酶蛋白与雷特格韦分子间结合自由能。结果与1BL3整合酶蛋白结构相比,分别携带K14R、V31I、V54I,I72V、I84M,T112V、T124A、T125A、G134N、I135V、K136R、D167E、G193E、V201I、L203I氨基酸突变的整合酶蛋白与雷特格韦之间未见明显分子间结合自由能改变。引入已知耐药基因突变N155H,Q148H,Y143C的整合酶结构可造成彼此间分子自由能的明显提高。结论分子模拟技术建立雷特格韦与整合酶蛋白耐药性预测模型,完成了整合酶野生型蛋白结构与雷特格韦之间结合自由能计算和耐药性分析。我国HIV-1整合酶流行株对雷特格韦敏感,不存在耐药性。
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