首页> 中文期刊> 《病毒学报》 >慢性蜜蜂麻痹病毒Ch1株的编码区测序及其序列的分析

慢性蜜蜂麻痹病毒Ch1株的编码区测序及其序列的分析

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

对中国分离株慢性蜜蜂麻痹病毒(Chronic bee paralysis virus,CBPV)Ch1编码区全基因序列进行克隆、测序、分析。利用RT-PCR方法和生物信息学软件,对本实验室分离到的Ch1株CBPV编码区的基因序列进行克隆,测序,与GenBank收录的CBPV毒株进行同源性比较,并以RdRp为靶基因构建了遗传进化树。结果显示,CBPV Ch1株的编码区由RNA1(GenBank No.KU950353)和RNA2(GenBank No.KU950354)两部分构成,全长5 979个核苷酸。其中RNA1片段全长3 674个核苷酸,编码3个开放阅读框,RNA2片段全长2 305个核苷酸,编码4个开放阅读框,RNA2片段中ORF2和ORF3,可能编码两个结构蛋白,分别命名为SP1和SP2。RNA1和RNA2核苷酸序列与2005年法国分离株Fr2核苷酸序列同源性最高,分别为96.1%和95.5%,但预测蛋白SP1核苷酸序列同源性与2006年乌拉圭分离株Ur1核苷酸序列同源性最高(96.9%)。基于RdRp为靶基因进行了遗传进化分析表明,Ch1株与Fr2株位于同一分支,且在该区域,Ch1株与Fr2株的核苷酸序列同源性最高(96.5%)。本实验成功分离到一株CBPV(KU950353,KU950354),并命名为Ch1株,完成了Ch1株CBPV的编码区的序列测定以及核苷酸序列与推导的氨基酸序列同源性比较及遗传进化分析,为研究CBPV的致病机制和免疫机制提供重要信息。

著录项

来源
《病毒学报》 |2017年第2期|238-244|共7页
作者
魏东; 钟义; 张皓淳; 姜莉莉; 费东亮; 胡影; 李芳兵; 张鹤; 岳金金; 马鸣潇;
展开▼
作者单位

锦州医科大学畜牧兽医学院;

辽宁锦州121000;

辽宁省动物疫病预防控制中心;

辽宁沈阳110164;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 S895.234;
关键词
慢性麻痹病毒; 基因组测序; 序列分析;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 慢性蜜蜂麻痹病毒中国株RNA1序列克隆及进化分析 [J] . 李贝贝 ,侯春生 ,刁青云 . 中国蜂业 . 2017,第5期
2. 4株SARS冠状病毒中国分离株3′非编码区的序列测定及分析 [J] . 范宝昌 ,姜涛 ,于曼 . 中国生物化学与分子生物学报 . 2003,第3期
3. 江苏地区对虾3种病毒病的流行病学调查及5株IHHNV的编码区基因序列分析 [J] . 王筱珊 ,胡智博 ,费荣梅 . 水产学报 . 2017,第10期
4. 鸡传染性支气管炎病毒HQ P_(10)毒株非编码区序列分析 [J] . 韩绪春 ,何锡栋 ,黄宝钦 . 中国家禽 . 2015,第8期
5. 鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株3'端非编码区序列分析 [J] . 磨美兰 ,范文胜 ,黄柏成 . 基因组学与应用生物学 . 2010,第3期
6. 猪口蹄疫病毒OLZ02株基因组编码区的核苷酸序列及其氨基酸序列分析 [C] . 刘光清 . 中国畜牧兽医学会口蹄疫学分会第九次全国口蹄疫学术研讨会 . 2003
7. 两株猪源日本脑炎病毒的分离鉴定与编码区序列克隆分析 [A] . 石双艳 . 2014

获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

客服微信
服务号