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广西单核细胞增生李斯特菌数据库的建立及菌株特征分析

         

摘要

目的 掌握2002—2020年广西3种来源(食源株、病源株及健康人员携带株)单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)耐药情况和菌株的耐药基因、血清群、基因型及相互之间的分布特征,构建广西LM数据库,应用于LM引起的食源性疾病暴发的识别和调查。方法 采用肉汤稀释法测定LM抗生素敏感性;通过全基因组测序获取LM谱系、血清群、序列分型(ST)、克隆群(CC)及耐药基因分布。结果 317株实验菌株分属3个谱系、5个血清群、32个ST型、22个CC型及1个未分型的ST619,谱系Ⅱ和Ⅱa血清群占比最高,分别为57.41%(182/317)、43.53%(138/317),优势ST型及CC型分别为ST8(17.98%)、ST87(12.62%)、ST9(11.99%)和CC8(17.98%)、CC9(13.88%)、CC87(12.93%)。食源株优势菌株主要分布于谱系Ⅱ、Ⅱa、CC8和Ⅱc、CC9及谱系Ⅰ、Ⅱb、CC87;7株病源株中6株为谱系Ⅰ、Ⅳb;4株健康人员携带株全部为谱系Ⅱ、Ⅱa、CC8。依据CLSI M45-2015及EUCAST-2017判定标准,仅1株菌株对ERY耐药,耐药率为0.32%;依据MIC90值,推断有6株菌(1.89%)极可能对TET耐药。仅9株菌株携带耐药基因,占2.84%,包括tet(M)、dfrG、Msr(D)、Mef(A)、blaA,携带四环素耐药基因tet(M)菌株数最多(7株),2株菌携带3个耐药基因。12株耐药/高MIC值菌株5株来源于餐饮食品,占比41.67%,6株携带耐药基因,其中1株对ERY耐药且TET呈现高MIC值。11株人源株均无耐药、高MIC值及携带耐药基因等情况。结论 广西LM菌株总体以Ⅱa血清群为主,CC8、CC9、CC87为优势CC型,病源株主要为Ⅳb血清群,健康携带株为Ⅱa、CC8,菌株耐药率及耐药基因携带率不高,餐饮食品来源菌株在耐药/高MIC值菌株中占比高,对病人的治疗用药具有重要的指导意义。

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