中华鳖体表和体内菌群多样性分析

胡广洲; 李登峰; 苏秀榕; 李太武; 贺静静

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中华鳖体表和体内菌群多样性分析

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采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树.在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序.结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌.

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来源
《水产科学》 |2010年第7期|393-398|共6页
作者
胡广洲; 李登峰; 苏秀榕; 李太武; 贺静静;
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作者单位

应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;

应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;

应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;

应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;

应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类龟、鳖、鳄鱼养殖;
关键词
中华鳖; 16S rDNA; RFLP; 细菌多样性;

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