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猪流行性腹泻病毒 E 和M 基因的克隆及变异分析

         
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摘要

To investigate the proteinvariationsin the porcine epidemic diarrhea virus (PEDV),19 E and 18 M genes from the viruses collected from different farms in Fujian in 2012 -2014 were cloned and sequenced.The results indicated that the PEDV E and M genes were conservative.There were individual variants foundonlyonamino acids, as compared with CV777 strain.On the nucleotide sequences,the E geneswere 97.4% - 100.0% homogenous among themselves,97.4%-100.0% homogenous with attenuated DR13 strain,and 97.0%-99.6% homogenous with CV777 strain.For the M genes,they were 97.4%-100.0% homogenous among the 18 of them,97.2% -99.6% homogenous with attenuated DR13,and 97.5%-98.4% homogenous with CV777. A phylogenetic analysis indicated that the E genes of the 19 PEDVs were closely related to CV777,and the M genes of the 18 PEDVs closely related to KU05CB08.The M gene wasa new variant,which might bear an origin of strains from Thailand.%为了解2012－2014年福建省流行 PEDV 毒株 E 和 M 基因的变异情况，对19株 PEDV 的 E 基因和18株 PEDV 的 M 基因进行克隆和序列分析。结果表明：与 CV777标准毒株相比较，福建流行 PEDV 毒株的 E 和M 基因存在编码的部分氨基酸变异。19株 PEDV E 基因的核苷酸之间的同源性为97．4％～100．0％，与attenuated DR13弱毒株和 CV777标准株同源性分别为97．4％～100．0％和97．0％～99．6％。18株 PEDV M 基因的核苷酸之间的同源性为97．4％～100．0％，与 attenuated DR13弱毒株和 CV777标准株同源性分别为97．2％～99．6％和97．5％～98．4％。核苷酸遗传进化树表明福建流行 PEDV 毒株的 E 基因与 CV777亲缘关系较近，而M 基因与2008年泰国流行的 KU05CB08毒株亲缘关系较近，是个新的基因型，可能源于泰国。

著录项

  • 来源
    《福建农业学报》 |2015年第6期|533-538|共6页
  • 作者

    王隆柏; 王晨燕; 林裕胜; 车勇良; 吴学敏; 陈如敬; 周伦江;

  • 作者单位

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

    福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;

    福建 福州 350013;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    猪流行性腹泻病毒; E 和 M 基因; 变异分析;

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