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不同年份2.3.4.4分支H5亚型禽流感病毒HA基因的序列分析

         

摘要

cqvip:H5亚型禽流感2.3.4.4分支病毒作为我国优势流行毒株已流行多年,流行毒株是否会因变异而导致免疫失败引起关注。本研究对2014-2017年流行毒株进行测序,比较分析了其抗原位点的变异情况,结果发现2017年的流行毒株已发生较大的变异,形成了一个独立的分支,与其之前的毒株HA核苷酸序列的差异达4.4%-5.4%。其最大特征是HA蛋白的142位E(按A/Goose/Guangdong/1/96毒株排序)发生缺失,导致该处增加了1个糖基化位点;同时受体结合位点的口袋右缘发生L145S的变异,而这一位点的变异在2016年的毒株就已产生;2017的毒株另有12个aa发生了较为一致的变异。故推测当前毒株的抗原性已发生了较大变化。但238位(H3排序226位)匀为Q,保持禽源毒株的特征。就当前而言需改用Re-11或rFJ56株疫苗才能起到好的效果。

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