广东地区GBV-C/HGV5'NCR区序列变异的研究

付涌水; 曹开源; 吕凌

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广东地区GBV-C/HGV5'NCR区序列变异的研究

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目的了解广东地区GBV-C/HGV 5′NCR区的序列变异情况.方法以GBV-C和HGV的5′NCR区完全同源的序列设计合成引物用于套式RT-PCR.从广东地区的10例GBV-C/HGV感染者血中扩增了10个序列,分别克隆至pUC19或pT-Adv载体.以35 S标记的双脱氧链末端终止法对这10个序列分别进行正反两个方向的序列测定.结果 10株序列相互间同源性最大为100%,最小为84.4%.与Genbank所载3个标准株的相应序列比较,其同源性最大为89.4%,最小为83.9%.与国内周育森报道的相应序列比较,两者之间的同源性最大为96.1%,最小为85.0%.比较还发现,这10株序列的起始处有一段38 nt的区域与上述标准序列相比变异比较大,其与标准序列的同源性最高只有79.0%,最低为60.5%.其中9株相互间的这一38 nt序列的同源性则高达92%～100%.结论广东地区流行的庚型肝炎病毒大多带有HGV的特殊点.少数为GBV-C.

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来源
《广东医学》 |2000年第5期|373-374|共2页
作者
付涌水; 曹开源; 吕凌;
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作者单位

广东省广州血液中心,510095;

中山医科大学分子医学研究中心,510080;

中山医科大学分子医学研究中心,510080;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基础医学;
关键词
克隆,分子; 序列分析,DNA; 肝炎病毒组,庚型; 聚合酶链反应;

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