真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究

张昕; 孙国昌; 姜华; 王艳丽; 张震; 毛雪琴; 柴荣耀; 邱海萍; 杜新法; 王教瑜

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The family members oiPEX11 are key factors involved in regulation of peroxisome proliferation. Sixty-six PEXllp candidates of PEX11 gene family from26 representative fungal species were obtainedand analyzed by bioinfor-matic strategies. In most filamentous fungi, 2 or 3 potential PEX11ps were found, in conirast with 1 or 2 in yeast species.Compared with other fungal species, the Ascomycetes tend to have more PEX11ps, and even 5 in several individuals. The data of phylogenetic analysis and protein structure indicated that all of the PEXllps were divided into 3groups: I, n, and HI. The members of group I and groupIIIexisted in most species, while those in group II were found only in Pezizomycotina. By MEME analysis, 5-6 conserved motifs were found in each PEX11ps. Among thenvnotif 8 in C-terminal had the most conservation, indicating that this motif probably plays a key role in maintaining the proper functionof PEXllp.%PEXll基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEXll基因家族成员进行了检索和进化分析.研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEXllp.酵母类真菌有1个或2个PEXllp,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEXllp的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEXllp可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEXllp,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅲ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEXllp含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEXIlp发挥功能具有重要作用.文章对进一步研究真菌PEXIlp的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义.

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来源
《遗传》 |2012年第5期|635-646|共12页
作者
张昕; 孙国昌; 姜华; 王艳丽; 张震; 毛雪琴; 柴荣耀; 邱海萍; 杜新法; 王教瑜;
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作者单位

杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310036;

浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021;

浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021;

浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021;

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浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021;

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正文语种 chi
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关键词
真菌; 过氧化物酶体; PEXll基因家族; 生物信息学; 进化分析;

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