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益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置分析

         

摘要

目的:对益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置进行分析,旨在为益母草种质资源的开发和利用提供科学依据.方法:采用二代测序技术对益母草全基因组DNA进行测序,并成功组装了其完整的叶绿体基因组.结果:益母草叶绿体基因组全长159 375 bp,由一个大的单拷贝区(LSC) 87 204 bp,一个小的单拷贝区(SSC)17 515 bp和一对27 099 bp的反向重复序列(IRs)组成.基因组注释结果显示其共编码115个基因,包括99个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因.叶绿体基因组GC含量为38.41%.同时,本研究共检测到160个简单重复序列和49个串联重复序列.结论:系统发育分析表明,益母草属与水苏属的亲缘关系较近,本研究为益母草药材精准鉴定与遗传多样性研究奠定了基础.

著录项

  • 来源
    《中医药信息》 |2018年第4期|21-27|共7页
  • 作者单位

    中国医学科学院北京协和医学院,药用植物研究所,北京100193;

    中国医学科学院北京协和医学院,药用植物研究所,北京100193;

    厦门出入境检验检疫局技术中心,厦门361026;

    中国医学科学院北京协和医学院,药用植物研究所,北京100193;

    江苏出入境检验检疫局,江苏南京210001;

    厦门出入境检验检疫局技术中心,厦门361026;

    河南出入境检验检疫局,河南郑州450003;

    中国医学科学院北京协和医学院,药用植物研究所,北京100193;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 中药实验药理;
  • 关键词

    益母草; 叶绿体基因组; 重复序列; 系统进化;

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