不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析

杨佳栋; 刘月琴; 张英杰

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不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析

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为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过CodonW软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲缘关系.GCT、TGT、TTT、ATT、CCT、AGA、ACT为哺乳动物GDF9基因的最优密码子,该基因偏爱使用以A或T结尾的密码子;G、C含量和蛋白质亲水性是影响GDF9基因密码子偏性的主要因素;聚类分析提示不同哺乳动物间的同源性越高,GDF9基因密码子使用特征的相似性越高.

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来源
《江苏农业科学》 |2017年第15期|41-45|共5页
作者
杨佳栋; 刘月琴; 张英杰;
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作者单位

河北农业大学动物科技学院;

河北保定 071000;

河北农业大学动物科技学院;

河北保定 071000;

河北农业大学动物科技学院;

河北保定 071000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类遗传密码;
关键词
哺乳动物; GDF9; 碱基替换; 密码子偏性; 聚类分析;

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