鹌鹑核酸序列中的微卫星标记分析

白俊艳; 赵淑娟; 庞有志

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鹌鹑核酸序列中的微卫星标记分析

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在已公布的鹌鹑核酸序列和EST序列总计635条序列的1～6核苷酸重复SSR的分布中,共发现120条SSR,检出率为18.9%.二核苷酸重复基元的SSR占40.0%,三核苷酸重复基元的SSR占35.8%,五核苷酸重复基元和四核苷酸重复基元的SSR分别占14.2%和10.0%,没有发现六核苷酸重复基元的SSR.组成这些SSR的主要基序有AT/TA、CA/GT、GA/CT、CAG/GTC、AGG/TCC、TAA/AAT、GGC/CGG、GAC/CTG、CGA/GCT、GCA/CGT、GAG/CTC、ACC/CCA、TCTT、TTTG、TCCA、ATGAT/ATCAT、TCCCT、TTCCC.SSR的重复次数都在5以上,由此可以推测利用鹌鹑核苷酸序列和EST序列中的SSR序列将有可能开发一批有价值的SSR分子标记供各种研究所用.

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来源
《江苏农业科学》 |2010年第4期|31-32|共2页
作者
白俊艳; 赵淑娟; 庞有志;
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作者单位

河南科技大学动物科技学院;

河南郑州;

471003;

河南科技大学动物科技学院;

河南郑州;

471003;

河南科技大学动物科技学院;

河南郑州;

471003;

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正文语种 chi
中图分类 S839.1;
关键词
鹌鹑; 微卫星; 生物信息学方法;

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