五月龄翘嘴红鲌性腺组织小RNA转录谱的分析比较

曹访; 刘莉; 采克俊; 吴成龙; 周俊波

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五月龄翘嘴红鲌性腺组织小RNA转录谱的分析比较

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cqvip:采用转录组高通量测序方法,比较分析幼龄翘嘴红鲌精巢、卵巢组织中小RNA转录谱。结果显示,精巢、卵巢的小RNA分布的峰值分别为28、29 nt,与一般物种的22~24 nt有较大的差异;在小RNA库中,经比对注释的比例很低,分别为2.5%、2.1%。在比对注释的斑马鱼miRBase、斑马鱼ncRNA、piRNA、Rfam数据库中,精巢组织中被miRBase数据库注释的比例最高,为1.49%;而卵巢组织中被miRBase和piRNA数据库注释的比例接近,分别为0.94%和0.96%。比较表达量相对较高的共有miRNA分子,均是与胚胎发育相关的分子,且大多是精巢组织的表达量高于卵巢组织,这些miRNA分子在个体发育中可能具有重要意义。初步获得了翘嘴红鲌不同性腺组织的转录谱,为今后进一步分析小RNA在生殖发育中的调控作用奠定了基础。

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来源
《江苏农业科学》 |2020年第2期|77-82|共6页
作者
曹访; 刘莉; 采克俊; 吴成龙; 周俊波;
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作者单位

湖州师范学院生命科学学院/浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室/中国水产科学研究院水生动物繁育与营养重点实验室浙江湖州313000;

浙江省淡水水产研究所浙江湖州313001;

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正文语种 chi
中图分类水产动物学;
关键词
翘嘴红鲌; 精巢; 卵巢; miRNA; 转录谱; 分析; 比较;

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