牛ATP10A基因组织特异性印记研究

刘晓倩; 董艳秋; 靳兰杰; 谷书凯; 李冬杰; 李世杰

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牛ATP10A基因组织特异性印记研究

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基因组印记是存在于哺乳动物中的一种重要的表观遗传修饰机制,与生物体的生长发育密切相关.ATP10A(ATPase phospholipid transporting 10A)基因位于PWS/AS印记区域的一端,该印记区域与人类(Homo sapiens)的PWS(Prader-Willi syndrome)综合征和AS(Angelman syndrome)综合征发生有关.ATP10A基因在人中表现为大脑特异性的印记基因,而在牛(Bos taurus)中的印记状态未见报道.本研究首先对32头牛心脏组织和15个牛胎盘基因组DNA进行PCR扩增,通过产物直接测序鉴定基因组中的单核苷酸多态位点,在牛ATP10A基因外显子20上鉴定出A/G杂合的SNP位点(rs136134264).然后对杂合子牛各组织及胎盘总RNA进行RT-PCR,产物测序结果与上述杂合SNP位点进行对比,确定了ATP10A基因在牛大脑组织中为单等位基因表达,而在其他组织和胎盘中为双等位基因表达.进一步利用亚硫酸氢盐测序法,分析ATP10A基因启动子区在牛组织和胎盘中的DNA甲基化状态,发现所检测区域的46个CpG位点在牛组织和胎盘中均呈现轻甲基化状态,说明ATP10A基因启动子区的DNA甲基化修饰不参与调控ATP10A基因在牛中的印记表达.本研究可为深入探讨牛ATP10A基因功能和印记的分子机制提供参考依据.

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来源
《农业生物技术学报》 |2021年第11期|2109-2117|共9页
作者
刘晓倩; 董艳秋; 靳兰杰; 谷书凯; 李冬杰; 李世杰;
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作者单位

河北农业大学生命科学学院保定071001;

河北农业大学生命科学学院保定071001;

河北农业大学生命科学学院保定071001;

河北农业大学生命科学学院保定071001;

河北科技大学生物科学与工程学院石家庄050018;

河北农业大学生命科学学院保定071001;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类牛;生物技术遗传育种;基因工程（遗传工程）;
关键词
牛; PWS/AS印记区域; ATP10A (ATPase phospholipid transporting 10A); 印记状态; DNA甲基化;

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