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7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性分析

         

摘要

[目的]分析我国7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性.[方法]利用PCR技术扩增并测序7个地理种群100个小鼠样品的TLR9基因.使用MEGA 7.0、DnaSP等软件对基因序列进行分析,计算遗传距离、遗传多样性,并构建系统发育树.[结果]获得的TLR9基因片段长度为1030 bp,位于参与对病原体相关分子模式识别的LRR结构域的编码区,A、T、C、G的平均含量分别为22.9%、22.2%、32.8%和22.0%,各地理种群间碱基含量没有明显差异.通过计算各地理种群间遗传距离及核苷酸多样性发现,这7个地理种群小鼠TLR9基因序列较为保守,并无明显遗传分化.以褐家鼠(NM 198131)作为外群构建系统发育树,其结果与遗传多样性分析相一致.[结论]7个地理种群小鼠TLR9基因遗传多样性较低,具有极高的保守性.

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