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联合CGGA-TCGA数据库挖掘胶质瘤显著生存相关基因

         

摘要

利用CGGA与TCGA数据库,挖掘胶质瘤预后标志相关基因,结合差异分析、生存分析、共表达分析、临床相关性分析和ROC曲线评估预测能力,并通过TCGA验证,得到PLAT、IGFBP2、BCAT1和SERPINH1等4个可以作为独立预后标志因子的基因.分析表明,这4个基因不仅是独立的预后因子,还在不同人群中都具有较好的预后预测能力,说明找到的预后基因具有潜在的应用价值.对SERPINH1剪接事件进行分析,揭示可变剪接事件是影响患者预后的重要因素,这为进一步理解胶质瘤预后基因的特征提供了依据.

著录项

  • 来源
    《生物学杂志》 |2021年第1期|18-22|共5页
  • 作者单位

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学附属第四医院 哈尔滨150081;

    哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 哈尔滨150081;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 生物信息论;
  • 关键词

    胶质瘤; 生存分析; 预后因子; 选择性剪接;

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