芡实颗粒结合淀粉合成酶Ⅰ基因克隆及其生物信息学分析

王前; 邵永芳; 景宗慧; 刘莉成; 鲍锞; 吴啟南

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芡实颗粒结合淀粉合成酶Ⅰ基因克隆及其生物信息学分析

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目的：克隆芡实颗粒结合淀粉合成酶EfGBSSⅠ基因并对其进行生物信息学分析。方法：以芡的成熟种子为材料，采用RT-PCR方法克隆芡实EfGBSSⅠ基因，通过在线软件及工具对其进行生物信息学分析。结果：获得EfGBSSⅠ基因全长1 893 bp,编码区全长1 587 bp,编码528个氨基酸，不存在跨膜区及信号肽，为稳定的亲水性蛋白。系统进化分析表明，该序列与同科植物睡莲亲缘关系较近，并预测出8类顺式作用元件和28种具偏好性的密码子。结论：克隆得到预期芡实EfGBSSⅠ基因，掌握了EfGBSSⅠ基因编码氨基酸序列及蛋白质结构和功能等生物信息学特征，为深入研究该基因的功能及培育芡实优良品种提供了理论依据。

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来源
《中药材》 |2021年第10期|2293-2299|共7页
作者
王前; 邵永芳; 景宗慧; 刘莉成; 鲍锞; 吴啟南;
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作者单位

1. 南京中医药大学药学院/江苏省中药资源产业化过程协同创新中心 2. 中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心;

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正文语种 chi
中图分类 S567.219;
关键词
芡实; EfGBSSⅠ; 基因克隆; 生物信息学分析;

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