竹䇲鱼微卫星标记开发及跨物种扩增

LIANG Zhen-bang; WU Ren-xie; NIU Su-fang; LUO Hui-gui

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[目的]筛选高多态性竹?鱼(Trachurus japonicus)微卫星(SSR)标记,并验证其在鲹科鱼类中的通用性.[方法]采用SLAF-seq技术识别竹?鱼基因组SSR标记,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点,并进行跨物种PCR扩增.[结果与结论]识别出43264个二至六碱基重复SSR标记,二、三碱基重复SSR标记较多(90.33％).筛选出37个多态性的二、三碱基SSR位点,各位点的等位基因数为4～26,期望杂合度为0.481～0.935,多态信息含量为0.440～0.934.有30个位点符合哈迪-温伯格平衡,且各位点间不存在连锁不平衡现象.共有28个竹?鱼SSR标记可在1种以上鲹科鱼类中有效扩增,分别有24、21、20、19和11个SSR位点可在蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)、长身圆鲹(Decapterus macrosoma)、无斑圆鲹(Decapterus kurroides)、颌圆鲹(Decapterus macarellus)及金带细鲹(Selaroides leptolepis)中稳定扩增,可为竹?鱼遗传资源评估和部分鲹科鱼类的系统进化分析提供重要遗传物质基础及有力的分析手段.

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来源
《广东海洋大学学报》 |2019年第4期|5-12|共8页
作者
LIANG Zhen-bang; WU Ren-xie; NIU Su-fang; LUO Hui-gui;
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作者单位

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正文语种 chi
中图分类基因工程（遗传工程）;
关键词
竹䇲鱼; 微卫星标记; 跨物种扩增; SLAF-Seq技术;

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