欧猥迭宫绦虫膜联蛋白E1基因的生物信息学分析

邬强; 李东冬; 马盼盼; 吕刚

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欧猥迭宫绦虫膜联蛋白E1基因的生物信息学分析

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目的:从欧猥迭宫绦虫成虫cDNA文库中识别出膜联蛋白E1(Annexin E1)基因,并对其进行生物信息学分析和功能预测.方法:从欧猥迭宫绦虫cDNA文库中获取Annexin E1基因的核酸序列,应用NCBI、ExPASy等多种生物信息学在线分析工具结合Vector NTI Advance 10、Geneious Pro等软件包,对所获基因及其编码蛋白的基本理化特征、亚细胞定位、保守功能域、抗原表位、二级结构及拓扑结构等进行预测,建立蛋白质三级空间结构模型及构建其分子进化树.结果:Annexin E1编码354个氨基酸残基,理论分子量为40 168.0Da,具有4个完整的保守功能域.位于细胞内,无信号肽及跨膜结构,存在6个潜在抗原表位.二级结构主要以α螺旋为主,结构和功能有关的位点高度保守,具有多个磷酸化位点.在进化的过程中与绦虫类亲缘较近,而与脊椎类亲缘较远.结论:Annexin E1编码蛋白及潜在的抗原表位与宿主同源性低,可能作为研发新型免疫诊断方法的理想分子靶标.

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来源
《海南医学院学报》 |2010年第9期|1106-1110|共5页
作者
邬强; 李东冬; 马盼盼; 吕刚;
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作者单位

海南医学院热带医学与检验医学院,海南,海口,571101;

海南医学院热带医学与检验医学院,海南,海口,571101;

海南医学院热带医学与检验医学院,海南,海口,571101;

海南医学院热带医学与检验医学院,海南,海口,571101;

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正文语种 chi
中图分类绦虫;
关键词
欧猥迭宫绦虫; 膜联蛋白; 结构; 功能; 生物信息学;

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