基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析

赵立军; 魏利; 马放; 李芬; 张建祺

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基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析

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为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S～23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Sdmonella(02、17)、Clostridium(F4、D10、H1)、Anaerofilum(A8、A18)、Enterobacter(E1).聚类分析表明,菌株的ISR序列长度差异较大,包含的tRNA种类和数目不同,间隔区序列可以作为16S rDNA序列系统发育分类的一个有力的补充;气相色谱末端产物相似的菌株,亲源关系比较接近,可以作为细菌鉴定的依据;其中16S rDNA序列作为细菌分类的主要依据,对存在争议的菌株,应该结合形态、生理生化特征和ISR序列以及气相色谱末端产物等综合对其进行系统分类.

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来源
《哈尔滨工业大学学报》 |2008年第12期|1965-1968|共4页
作者
赵立军; 魏利; 马放; 李芬; 张建祺;
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作者单位

哈尔滨工业大学,市政环境工程学院,哈尔滨,150090;

中国石油大学,化学科学与工程学院,北京,昌平,102249;

哈尔滨工业大学,市政环境工程学院,哈尔滨,150090;

哈尔滨工业大学,市政环境工程学院,哈尔滨,150090;

哈尔滨工业大学,市政环境工程学院,哈尔滨,150090;

马里兰州立大学,土木环境工程系,美国,巴尔的摩,21250;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类环境微生物学;
关键词
硫酸盐还原菌; 16S rDNA; 16S～235 rDNA间隔区(ISR); 系统发育分析;

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