基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计

刘磊; 马英; 王润玲; 王树青; 徐为人

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基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计

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目的:虚拟筛选更高活性的神经氨酸酶(NA)抑制剂,提高抵抗变异病毒的能力,为以后相关疾病治疗新药的设计提供科学依据.方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模块对Leadnow数据库进行高通量虚拟筛选,对选出的结构用“Core Hopping”模块改造结构;利用Desmond2.4软件包进行分子动力学模拟研究,将NA的空载蛋白及靶点与筛选结果较好的配体小分子复合物共3个模型分别进行10 ns的分子动力学模拟.结果:高通量虚拟筛选得到一个五元环结构的化合物ZINC 13219479,并以此为核心向150-cavity延伸,得到8个能很好进入的结构.建立了靶向这些位点的配体库,方便后续有关研究的进行.分子动力学结果表明模拟过程中各靶点与配体复合物体系稳定,结合位点正确.作为抑制剂,小分子配体与NA酶的150-cavity区域残基形成稳定的氢键作用,牢牢占据NA的催化位点.结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与NA的结合能力理论上优于抑制剂达菲.在动力学模拟这些化合物后,更加确定了这些化合物的有效性,具有一定的科研价值.

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来源
《天津医科大学学报》 |2013年第3期|192-195|共4页
作者
刘磊; 马英; 王润玲; 王树青; 徐为人;
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作者单位

天津医科大学药学院,天津市临床药物关键技术重点实验室,天津300070;

天津医科大学药学院,天津市临床药物关键技术重点实验室,天津300070;

天津医科大学药学院,天津市临床药物关键技术重点实验室,天津300070;

天津医科大学药学院,天津市临床药物关键技术重点实验室,天津300070;

天津药物研究院,天津市新药设计与发现重点实验室,天津300193;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类药物设计;
关键词
神经氨酸酶; 流感病毒; 计算机辅助药物设计; 达菲; 150-cavity;

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