17种绵蟹线粒体COI基因比较及系统进化分析

韦丽明; 张莹; 吕振明; 龚理; 苗增良

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17种绵蟹线粒体COI基因比较及系统进化分析

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线粒体COI基因在物种鉴定及系统进化研究中有着广泛的应用。本研究测定了德汉劳绵蟹和阿特拉斯平壳蟹的线粒体COI序列,并从GenBank数据库中下载了15种绵蟹科种类的COI基因序列。对这17种绵蟹种类的COI序列进行比较分析发现遗传密码具有简并性。遗传距离及序列相似性分析显示4个德汉劳绵蟹个体中的德汉劳绵蟹2和3鉴定有误;本研究中所有物种都能被区分开,表明COI基因可以作为绵蟹科物种鉴定的分子标记。基于COI序列构建的最大似然树、贝叶斯树和最大简约树在属间水平差异较大,且支持率均较低,暗示COI片段有限的信息位点不适用于绵蟹科的系统发育分析;但是3种方法构建的系统树均表明绵蟹科未定种1和6以及德汉劳绵蟹1和4分别为同一物种,与遗传距离及序列相似性结果吻合。本研究在识别隐种及发现新种方面具有十分重要的潜在价值,同时也为生物多样性保护管理提供决策参考。

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来源
《浙江海洋大学学报：自然科学版》 |2022年第3期|202-210|共10页
作者
韦丽明; 张莹; 吕振明; 龚理; 苗增良;
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作者单位

浙江海洋大学海洋科学与技术学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类水产动物学;
关键词
绵蟹; DNA条形码; 物种鉴定; 同义密码子; 遗传距离; 系统发育;

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