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生物信息学预测IncRNA DLEU1的功能及其在膀胱癌中调控ncRNA代谢途径的作用

         

摘要

为了探讨淋巴细胞白血病缺失基因1 (deleted in lymphocytic leukemia 1,DLEU1)的功能及其在膀胱癌发展进程中相关联的基因及信号通路,采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology、Dcode、NCBI、GWAS Catalog、Targetvalidation、FireBrowse、Wanderer、GEPIA、Multi Experiment Matrix和Linke-dOmics等综合分析DLEU1基因的功能.结果显示:DLEU1基因定位于人13q14.2~q14.3且高度保守;该基因广泛表达于人体多种正常组织,并与身高、原发性胆汁性肝硬化等生物学表型相关;在膀胱癌等多种肿瘤中广泛高表达,且其高表达与膀胱癌总体生存率和无病生存率的显著降低相关.此外,基因信号通路富集分析结果显示,在膀胱癌等多种肿瘤中DLEU1均与ncRNA代谢途径密切相关.以上结果提示,DLEU1可能是膀胱癌潜在的癌基因和治疗靶点,其主要通过调节ncRNA代谢途径参与膀胱癌的进程.

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