极端嗜盐多形性古菌病毒HRPV13的分离鉴定及生物学特性

宋珊珊; 邓晓园; 杜鑫成; 欧阳淑珊; 陈向东

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极端嗜盐多形性古菌病毒HRPV13的分离鉴定及生物学特性

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【背景】与感染细菌和真核生物的病毒相比,目前发现的古菌病毒数量很少,但是却展现出形态多样性。因此,分离和鉴定新的古菌病毒具有重要意义。【目的】为了进一步了解古菌病毒的多样性,我们从青海省翡翠湖水样中分离到一株新的嗜盐古菌病毒株,研究其生物学特性并进行分类。【方法】首先通过挑取单菌落法分离嗜盐古菌,通过噬菌斑法获得嗜盐古菌病毒,PEG 6000两步沉淀法和CsCl密度梯度离心对病毒颗粒进行浓缩和纯化,用醋酸双氧铀对病毒负染染色,在透射电镜下观察病毒形态,提取病毒基因组后进行测序并进行生物信息学分析,以三氯乙酸法制备病毒蛋白样品并进行SDS-PAGE分析,分别用考马斯亮蓝和苏丹黑B染色并观察其蛋白和脂质条带。【结果】在以Halorubrum属极端嗜盐古菌K2菌株为敏感菌的双层平板上分离到了一株嗜盐古菌病毒,其噬菌斑为浊斑,透射电镜下呈多形性包膜病毒状,直径60 nm左右;含有9333 bp大小的双链环状DNA基因组,与已报道的β多形包膜病毒属(Betapleolipovirus)的HRPV11、HRPV12和HRPV10具有约75%的一致性,是该属的一个病毒新种。根据形态及基因组特征,将其归属于β多形包膜病毒属,命名为Halorubrum pleomorphic virus 13(HRPV13)。该病毒在50℃以下及pH 5.0−9.0具有较好活性,高盐浓度下具有侵染能力,而且病毒侵染宿主后不会造成宿主的大量裂解。【结论】通过电镜观察和生物学特性研究以及基因组测序分析,证实HRPV13为β多形包膜病毒属的新种,其分离和鉴定丰富了多形性病毒种类,这为研究不同区域多形性病毒的进化奠定了基础。

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来源
《微生物学通报》 |2022年第5期|1563-1580|共18页
作者
宋珊珊; 邓晓园; 杜鑫成; 欧阳淑珊; 陈向东;
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作者单位

武汉大学生命科学学院病毒学国家重点实验室;

湖北武汉430072;

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正文语种 chi
中图分类微生物鉴定;
关键词
嗜盐古菌; 环境病毒; 多形性病毒; 分离纯化;

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