罗氏沼虾亲虾越冬池中不同基质上微生物群落多样性分析

谢芹; 江敏; 胡成枫; 张健龙; 王城峰; 童晓岚; 顾德平; 胡伟国; 于忠利

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[目的]了解罗氏沼虾亲虾越冬时循环养殖系统对水质的调控效果,探明其中微生物群落的作用.[方法]采集循环养殖系统运行88 d后的越冬池池水、池中人工水草(普通纤维膜)以及外置式生物滤器中的纳米纤维膜等3种不同基质上的微生物,利用DNA抽提、PCR扩增和定量以及高通量MiSeq测序技术等对3种不同基质上的微生物进行16S rRNA基因序列V4-V5区的测定和分析,并根据测序得到的双端测序读长(Pair-end reads)进行质量控制和过滤,之后进行操作分类单元(OTU)聚类分析,并基于OTU对微生物群落的多样性指数和群落结构进行分析;每3-4 d对越冬池池水水质进行监测.[结果]养殖池塘的水质保持在良好的状态,其中氨氮和亚硝氮浓度控制在0.17+0.08 mg/L和0.28±0.15 mg/L;不同基质上的微生物组成和多样性都不相同.在3种基质上共检测并鉴定出细菌64种,隶属于9门64属,包括变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、酸杆菌门(Acidobacteria)和绿菌门(Chlorobi).从属水平上对3种基质上的细菌进行分析,发现养殖池水中含量最高的为丛毛单菌科下的一个未分类类群(Comamonadaceae unclassified),其也是3种基质的共有优势类群;普通纤维膜上为Inhella,纳米纤维膜上则是小纺锤状菌属(Fusibacter).3种基质上细菌群落多样性顺序为:纳米纤维膜＞普通纤维膜＞养殖池水.通过对亲虾越冬养殖全过程的水质监测,发现越冬期间亲虾池水质始终保持在良好状态,并且在循环水系统开启约40 d后水质达到了相对稳定的状态.[结论]通过在育苗池中悬挂人工水草,配合内含纳米纤维膜的外置式生物滤器,可使罗氏沼虾越冬亲虾池保持良好的水质.随着新型材料科学的发展,开发出适用于水产养殖业的滤料很有必要.

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来源
《微生物学通报》 |2017年第2期|336-347|共12页
作者
谢芹; 江敏; 胡成枫; 张健龙; 王城峰; 童晓岚; 顾德平; 胡伟国; 于忠利;
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作者单位

上海海洋大学水产与生命学院上海201306;

上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306;

上海海洋大学水产与生命学院上海201306;

上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306;

上海海洋大学水产与生命学院上海201306;

上海海洋大学水产与生命学院上海201306;

上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306;

陶氏化学(中国)投资有限公司上海201203;

陶氏化学(中国)投资有限公司上海201203;

上海市奉贤区水产技术推广站上海201499;

上海市奉贤区水产技术推广站上海201499;

上海市奉贤区水产技术推广站上海201499;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
生物膜; 高通量测序; 微生物群落多样性; 罗氏沼虾; 水质;

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