应用PCR-DGGE和Real-Time PCR分析健康与腹泻獭兔盲肠菌群

周毅; 文斌; 孙豪; 段玲; 傅祥超; 曾东; 倪学勤; 汪平

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[目的]研究獭兔腹泻发生后盲肠菌群结构的变化情况,为微生态防治断奶兔腹泻提供理论基础.[方法]分别提取5只健康和腹泻獭兔盲肠内容物总DNA,应用PCR-DGGE及Real-Time PCR技术比较分析獭兔盲肠中菌群结构的差异.[结果]腹泻獭兔PCR-DGGE图谱条带丰富度、均匀度、多样性指数与健康獭兔相比差异均不显著,但聚类分析和主成分分析(PCA)能够将腹泻组和健康组区分开.Real-Time PCR检测显示,腹泻獭兔盲肠正常菌群普雷沃氏菌、梭菌类群Ⅰ数量与健康獭兔相比没有变化(P＞0.05);链球菌属、梭菌类群Ⅳ和XⅣa、白色瘤胃球菌、溶纤维丁酸弧菌、普拉梭杆菌等有益微生物数量显著降低(P＜0.01),而埃希氏大肠杆菌数量却显著升高(P＜0.05).[结论]獭兔腹泻发生后盲肠有益微生物数量降低,有害微生物数量升高;菌群结构有差异但不显著(P＞0.05),腹泻獭兔盲肠菌群结构有复杂化的趋势.

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来源
《微生物学通报》 |2016年第1期|131-139|共9页
作者
周毅; 文斌; 孙豪; 段玲; 傅祥超; 曾东; 倪学勤; 汪平;
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作者单位

四川农业大学动物医学院四川成都611130;

四川省草原科学研究院四川成都611731;

四川农业大学动物医学院四川成都611130;

西南民族大学生命科学与技术学院四川成都610041;

四川省草原科学研究院四川成都611731;

四川农业大学动物医学院四川成都611130;

四川农业大学动物医学院四川成都611130;

四川省草原科学研究院四川成都611731;

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正文语种 chi
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关键词
腹泻; 肠道菌群; PCR-DGGE; Real-Time PCR; 獭兔;

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