基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

李珍珍; 郑司浩; 尚兴朴; 邓庭伟; 王继永; 赵润怀

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基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

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cqvip:目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力。方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率。结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析。各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psbA-trnH、ITS、ITS2、rbcL。ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小。Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小。NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开。结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合。本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据。

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来源
《中国现代中药》 |2020年第2期|207-212218|共7页
作者
李珍珍; 郑司浩; 尚兴朴; 邓庭伟; 王继永; 赵润怀;
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作者单位

江西中医药大学江西南昌 330004;

中国中药有限公司北京 100195;

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正文语种 chi
中图分类中药材;
关键词
甘草属; DNA条形码; 分子鉴别; 内转录间隔区;

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