养殖水体三种大型爆发性海洋藻类孢子/配子实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用初探

缪栋; 苏蕾; 张倩倩; 包卫洋; 龚骏

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一些大型海洋藻类在近海养殖环境中快速生长且容易形成青苔,严重威胁到养殖生物的安全并可能带来巨大的经济损失。检测青苔孢子的数量与动态,理解青苔爆发的环境生态学机制是防控与预警的基础。使用PCR方法,利用特异性引物对非爆发期的生物量进行检测,是监控有害藻类的有效方法。本工作针对海参养殖池塘三种常见的青苔藻(两种石莼Ulva cf.linza,Ulva sp.和萱藻Scytosiphon lomentaria)设计了以核糖体转录间隔区(ITS)为靶区域的种类特异性PCR引物,通过藻类和环境水样DNA对照实验检验其特异性和适用性。本工作建立了实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测养殖水体中藻类孢子/配子体含量,并实验得出该方法在三种藻类中的最低检出量,可最低检出200~400ITS rDNA拷贝。使用qPCR方法对烟台海参养殖水体2014年12月—2016年3月6个季度环境水样中的萱藻孢子/配子进行了定量检测,发现样品中萱藻孢子/配子ITS拷贝数的季节变化与青苔爆发规律呈现较高的吻合度,萱藻爆发前期伴随水体中孢子/配子量的增高,初步显示藻类爆发可用qPCR方法预测。

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来源
《中国海洋大学学报：自然科学版》 |2018年第8期|68-76|共9页
作者
缪栋; 苏蕾; 张倩倩; 包卫洋; 龚骏;
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作者单位

扬州大学环境科学与工程学院;

中国科学院烟台海岸带研究所;

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正文语种 chi
中图分类其他藻类的病害、敌害及其防治;
关键词
藻类爆发; 石莼; 萱藻; 特异性引物; 孢子; 配子; ITS; rDNA; 实时荧光定量PCR;

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