• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 中文期刊> 《林业科学》 >星天牛转录组及三大解毒酶家族相关基因系统发育分析

星天牛转录组及三大解毒酶家族相关基因系统发育分析

         
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

[目的]研究星天牛转录组信息及体内细胞色素P450单加氧酶(cytochrome P450 monooxygenase,CYP)、羧酸酯酶(carboxylesterase,CarE)和谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)三大解毒酶系的表达谱情况,通过构建系统进化树,探析其这3种酶系基因家族的类别及其系统演化关系,为星天牛对多寄主种类的适应性与杀虫剂的抗药性机制研究提供依据.[方法]采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeqTM 2500对星天牛进行转录组测序与数据分析,通过数据筛选并进一步与鞘翅目近缘物种的解毒酶同源蛋白进行系统发育分析.[结果]经测序、序列拼接得到55 260条unigenes,将其与公共数据库进行同源比对,注释了32 247条unigenes,在Swiss-Prot数据库注释的unigenes的数量最多(99.11％);注释到Nr数据库时与赤拟谷盗的unigenes同源性最高(60.25％);在GO数据库中,共有8 083个unigenes被成功注释,根据其功能大致可分为3类47亚类;在KEGG数据库中,4 600条unigenes与162个预测路径可以匹配.通过基因注释发现248条解毒酶系基因在星天牛体内表达,包括139条CYP基因、72条CarE基因、37条GST基因.系统发育分析发现,星天牛的大部分CYP基因都至少与一种鞘翅目近缘物种的CYP基因聚类在一起,P450基因中的CYP6家族数量与其他近缘物种(鞘翅目)类似,包含的基因数量最多;CarE解毒酶蛋白基因主要为β-酯酶、神经趋化蛋白、外源性代谢酶、未知等4种类型,分别可能参与星天牛的一些激素以及信息素的加工、神经和发育过程、消化与解毒等生理过程;星天牛的GST基因聚类主要包含Microsomal GST、Sigma GST、Omega GST、Delta GST、Theta GST等亚家族,具有保护生物大分子免受氧化损伤、催化活力等功能.[结论]本研究获得星天牛的转录组信息,初步探明星天牛体内三大解毒酶系的表达谱及分化情况,可为星天牛对多寄主种类的适应性与杀虫剂抗药性的产生及遗传机制研究提供基础数据和参考.

著录项

  • 来源
    《林业科学》 |2019年第5期|104-113|共10页
  • 作者

    韩小红; 卢赐鼎; 华银; 林浩宇; 是雨霏; 吴松青; 张飞萍; 梁光红;

  • 作者单位

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学生态公益林重大有害生物防控福建省高校重点实验室 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学生态公益林重大有害生物防控福建省高校重点实验室 福州 350002;

    福建农林大学林学院 福州 350002;

    福建农林大学生态公益林重大有害生物防控福建省高校重点实验室 福州 350002;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 鞘翅目害虫;
  • 关键词

    星天牛; 转录组; 高通量测序; 系统发育; 解毒酶蛋白基因;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号