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福建省枳椇种质资源遗传多样性的ISSR分析

         

摘要

cqvip:通过建立和优化枳椇Hovenia acerba的ISSR反应体系,并利用ISSR分子标记方法,对福建省12个种源地35份枳椇材料进行遗传多样性及亲缘关系研究。枳椇遗传多样性分析的ISSR最佳反应体系为反应总体积25μL,10×Ex Taq Buffer(Mg2+plus)2.5μL,dNTP Mixture 375μmol·L^-1,引物0.4μmol·L^-1,DNA模板75 ng,Ex Taq酶1 U,ddH2O 14.55μL。程序:预变性94℃5 min;变性94℃30 s,退火50℃1 min,延伸72℃90 s,共35个循环;最后延伸72℃7 min。利用筛选出的10个ISSR引物共检测了基因组DNA中175个位点,其中多态性位点155个,占总位点数的88.57%。供试材料观测等位基因数(Na)1.8857、有效等位基因数(Ne)1.4300,Nei’s基因多样性指数(H)0.2572,Shannon多样性指数(I)0.3959。UPGMA聚类分析表明,以遗传相似系数0.74为阈值,可将35份枳椇分成四大组。ISSR标记有效地揭示福建省枳椇种质资源丰富的遗传多样性,具较大开发利用价值。

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