含磷酸结合口袋的BRCT结构域功能位点预测

盛自章; 黄京飞

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含磷酸结合口袋的BRCT结构域功能位点预测

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BRCT(BRCA1C-terminus)是真核生物DNA损伤修复系统重要的信号传导和蛋白靶向结构域。为了探讨含磷酸结合口袋的BRCT与磷酸化配体结合的机制,对XRCC1BRCT1、PTIP BRCT4、ECT2BRCT1和TopBP1BRCT1进行了结构保守性和表面静电势分析。结果显示,4个BRCT的磷酸结合口袋周围所存在的结构保守并带正电势的沟槽很可能是其功能位点,并且类似的沟槽在含磷酸结合口袋的BRCT中普遍存在。沟槽两侧及底部均带有极性氨基酸残基,两侧带正电荷,而底部疏水。这说明沟槽与配体的结合以静电和疏水相互作用为主。沟槽主要位于单个BRCT中,而且4个BRCT的沟槽在形状和电荷分布上都不同,说确明BRCT配体特异性主要由单个BRCT决定。磷酸结合口袋位于沟槽中心,说明沟槽可能同时结合磷酸化残基的N端和C端附近残基。

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来源
《动物学研究》 |2011年第5期|509-514|共6页
作者
盛自章; 黄京飞;
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作者单位

中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室;

中国科学院研究生院;

中国科学院昆明动物研究所和香港中文大学生物多样性和人类疾病模型联合研究中心;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类糖（醣）;生物信息论;
关键词
BRCT结构域; 磷酸结合口袋; DNA损伤修复; 表面静电势;

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