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【2h】

Caught in the middle with multiple displacement amplification: the myth of pooling for avoiding multiple displacement amplification bias in a metagenome

机译：陷入多重置换扩增的中间：避免在一个基因组中避免多重置换扩增偏差的合并神话

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摘要

BackgroundShotgun metagenomics has become an important tool for investigating the ecology of microorganisms. Underlying these investigations is the assumption that metagenome sequence data accurately estimates the census of microbial populations. Multiple displacement amplification (MDA) of microbial community DNA is often used in cases where it is difficult to obtain enough DNA for sequencing; however, MDA can result in amplification biases that may impact subsequent estimates of population census from metagenome data. Some have posited that pooling replicate MDA reactions negates these biases and restores the accuracy of population analyses. This assumption has not been empirically tested.
机译：背景hot弹枪宏基因组学已成为研究微生物生态学的重要工具。这些研究的基础是，假设基因组基因组序列数据可以准确估计微生物种群的普查。在难以获得足够的DNA进行测序的情况下，经常使用微生物群落DNA的多重置换扩增（MDA）。但是，MDA可能会导致扩增偏倚，从而可能影响随后根据后代基因组数据进行的人口普查估计。一些人认为，合并重复MDA反应可以消除这些偏差，并恢复总体分析的准确性。该假设尚未经过经验检验。

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