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【2h】

Fuzzy set-based generalized multifactor dimensionality reduction analysis of gene-gene interactions

机译：基因-基因相互作用的基于模糊集的广义多因素降维分析

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摘要

BackgroundGene-gene interactions (GGIs) are a known cause of missing heritability. Multifactor dimensionality reduction (MDR) is one of most commonly used methods for GGI detection. The generalized multifactor dimensionality reduction (GMDR) method is an extension of MDR method that is applicable to various types of traits, and allows covariate adjustments. Our previous Fuzzy MDR (FMDR) is another extension for overcoming simple binary classification. FMDR uses continuous member-ship values instead of binary membership values 0 and 1, improving power for detecting causal SNPs and more intuitive interpretations in real data analysis. Here, we propose the fuzzy generalized multifactor dimensionality reduction (FGMDR) method, as a combined analysis of fuzzy set-based analysis and GMDR method, to detect GGIs associated with diseases using fuzzy set theory.
机译：背景基因-基因相互作用（GGI）是遗传力缺失的已知原因。多因素降维（MDR）是最常用的GGI检测方法之一。广义多因素降维（GMDR）方法是MDR方法的扩展，适用于各种类型的性状，并允许进行协变量调整。我们之前的Fuzzy MDR（FMDR）是克服简单二进制分类的另一个扩展。 FMDR使用连续的成员资格值代替二进制成员资格值0和1，从而提高了检测因果SNP的能力并在实际数据分析中提供了更直观的解释。在此，我们提出了基于模糊集分析和GMDR方法的组合分析的模糊广义多因素降维（FGMDR）方法，利用模糊集理论来检测与疾病相关的GGI。

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