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Atlas2 Cloud: a framework for personal genome analysis in the cloud

机译:Atlas2 Cloud:云中个人基因组分析的框架

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摘要

BackgroundUntil recently, sequencing has primarily been carried out in large genome centers which have invested heavily in developing the computational infrastructure that enables genomic sequence analysis. The recent advancements in next generation sequencing (NGS) have led to a wide dissemination of sequencing technologies and data, to highly diverse research groups. It is expected that clinical sequencing will become part of diagnostic routines shortly. However, limited accessibility to computational infrastructure and high quality bioinformatic tools, and the demand for personnel skilled in data analysis and interpretation remains a serious bottleneck. To this end, the cloud computing and Software-as-a-Service (SaaS) technologies can help address these issues.
机译:背景技术直到最近,测序一直主要在大型基因组中心进行,该中心已大力投资开发可进行基因组序列分析的计算基础设施。下一代测序(NGS)的最新进展已导致测序技术和数据广泛传播给高度多样化的研究小组。预计临床测序将很快成为诊断程序的一部分。然而,对计算基础设施和高质量生物信息工具的访问受限,并且对数据分析和解释熟练的人员的需求仍然是一个严重的瓶颈。为此,云计算和软件即服务(SaaS)技术可以帮助解决这些问题。

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