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Software-based analysis of bacteriophage genomes physical ends and packaging strategies

机译：基于软件的噬菌体基因组物理末端和包装策略分析

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摘要

BackgroundPhage genome analysis is a rapidly growing field. Recurrent obstacles include software access and usability, as well as genome sequences that vary in sequence orientation and/or start position. Here we describe modifications to the phage comparative genomics software program, Phamerator, provide public access to the code, and include instructions for creating custom Phamerator databases. We further report genomic analysis techniques to determine phage packaging strategies and identification of the physical ends of phage genomes.
机译：背景噬菌体基因组分析是一个快速发展的领域。经常遇到的障碍包括软件访问和可用性，以及序列方向和/或起始位置不同的基因组序列。在这里，我们描述了对噬菌体比较基因组学软件程序Phamerator的修改，提供了对代码的公共访问，并包括用于创建自定义Phamerator数据库的说明。我们进一步报告了基因组分析技术，以确定噬菌体包装策略和噬菌体基因组的物理末端的识别。

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