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首页> 美国卫生研究院文献>BMC Bioinformatics >FERN – a Java framework for stochastic simulation and evaluation of reaction networks
【2h】

FERN – a Java framework for stochastic simulation and evaluation of reaction networks

机译：FERN –用于随机模拟和评估反应网络的Java框架

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BackgroundStochastic simulation can be used to illustrate the development of biological systems over time and the stochastic nature of these processes. Currently available programs for stochastic simulation, however, are limited in that they either a) do not provide the most efficient simulation algorithms and are difficult to extend, b) cannot be easily integrated into other applications or c) do not allow to monitor and intervene during the simulation process in an easy and intuitive way. Thus, in order to use stochastic simulation in innovative high-level modeling and analysis approaches more flexible tools are necessary.
机译：背景技术随机模拟可用于说明生物系统随着时间的发展以及这些过程的随机性。但是，当前可用的随机仿真程序受到限制，因为它们要么a）不提供最有效的仿真算法并且难以扩展，b）无法轻松集成到其他应用程序中，或者c）不允许监视和干预在仿真过程中以简单直观的方式进行。因此，为了在创新的高级建模和分析方法中使用随机模拟，需要更灵活的工具。

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