systemsDock: a web server for network pharmacology-based prediction and analysis

机译：systemsDock：Web服务器用于基于网络药理学的预测和分析

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We present systemsDock, a web server for network pharmacology-based prediction and analysis, which permits docking simulation and molecular pathway map for comprehensive characterization of ligand selectivity and interpretation of ligand action on a complex molecular network. It incorporates an elaborately designed scoring function for molecular docking to assess protein–ligand binding potential. For large-scale screening and ease of investigation, systemsDock has a user-friendly GUI interface for molecule preparation, parameter specification and result inspection. Ligand binding potentials against individual proteins can be directly displayed on an uploaded molecular interaction map, allowing users to systemically investigate network-dependent effects of a drug or drug candidate. A case study is given to demonstrate how systemsDock can be used to discover a test compound's multi-target activity. systemsDock is freely accessible at .

机译：我们介绍了systemsDock，这是一种用于基于网络药理学的预测和分析的Web服务器，它允许对接模拟和分子途径图，以全面表征配体选择性并解释复杂分子网络上的配体作用。它结合了精心设计的评分功能，用于分子对接，以评估蛋白质-配体的结合潜力。为了进行大规模筛选和简化研究，systemsDock具有易于使用的GUI界面，用于分子制备，参数指定和结果检查。针对单个蛋白质的配体结合潜力可以直接显示在上传的分子相互作用图上，从而使用户能够系统地研究药物或候选药物的网络依赖性作用。进行了案例研究，以演示如何使用systemsDock发现测试化合物的多目标活性。可以从访问免费的systemsDock。

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期刊名称 Nucleic Acids Research
作者
Kun-Yi Hsin; Yukiko Matsuoka; Yoshiyuki Asai; Kyota Kamiyoshi; Tokiko Watanabe; Yoshihiro Kawaoka; Hiroaki Kitano;
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作者单位

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年(卷),期 2016(44),Web Server issue
年度 2016
页码 W507–W513
总页数 7
原文格式 PDF
正文语种
中图分类分子生物学;
关键词

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