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【24h】

Comparative transcriptomics of choroid plexus in Alzheimer’s disease, frontotemporal dementia and Huntington’s disease: implications for CSF homeostasis

机译:阿尔茨海默氏病,额颞叶痴呆和亨廷顿氏病脉络丛的转录组学研究:对脑脊液稳态的影响

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摘要

In Alzheimer’s disease, there are striking changes in CSF composition that relate to altered choroid plexus (CP) function. Studying CP tissue gene expression at the blood–cerebrospinal fluid barrier could provide further insight into the epithelial and stromal responses to neurodegenerative disease states. Transcriptome-wide Affymetrix microarrays were used to determine disease-related changes in gene expression in human CP. RNA from post-mortem samples of the entire lateral ventricular choroid plexus was extracted from 6 healthy controls (Ctrl), 7 patients with advanced (Braak and Braak stage III–VI) Alzheimer’s disease (AD), 4 with frontotemporal dementia (FTD) and 3 with Huntington’s disease (HuD). Statistics and agglomerative clustering were accomplished with MathWorks, MatLab; and gene set annotations by comparing input sets to GeneGo ( http://www.genego.com ) and Ingenuity ( http://www.ingenuity.com ) pathway sets. Bonferroni-corrected hypergeometric p-values of?
机译:在阿尔茨海默氏病中,与脉络丛神经(CP)功能改变有关的脑脊液成分发生了惊人的变化。研究血液-脑脊液屏障处CP组织基因的表达可以提供对神经退行性疾病状态的上皮和基质反应的进一步了解。全转录组Affymetrix微阵列用于确定人类CP中与疾病相关的基因表达变化。从6个健康对照(Ctrl),7个晚期(Braak和Braak III–VI期)阿尔茨海默病(AD),4个额颞叶性痴呆(FTD)和3患有亨廷顿氏病(HuD)。统计和聚集聚类是通过MathWorks,MatLab完成的;通过将输入集与GeneGo(http://www.genego.com)和Ingenuity(http://www.ingenuity.com)路径集进行比较,来对基因集进行注释和基因集注释。 Bonferroni校正的超几何p值≤0.1,被认为是集合之间的显着重叠。与Ctrls相比,晚期AD患者的CP中出现了明显的基因表达差异。在上调的基因中,包括急性期反应,细胞因子,细胞粘附,干扰素和JAK-STAT以及mTOR在内的代谢和免疫相关途径显着丰富。蛋氨酸降解,claudin-5和蛋白质翻译基因被下调。在FTD和HuD中观察到AD患者的许多基因表达发生了变化(例如claudin-5,紧密连接下调),但疾病组之间存在显着差异。在AD和HuD(但不是FTD)中,几种神经免疫调节干扰素显着富集(例如,在AD中:IFI-TM1,IFN-AR1,IFN-AR2和IFN-GR2)。与AD相关的表达变化,而不是HuD和FTD中的那些变化,被丰富用于上调VEGF信号传导和免疫应答蛋白,例如白介素。 HuD和FTD患者明显表现出钙粘蛋白介导的上调。我们的人类CP组织的转录数据为基因组和上皮成分的AD,FTD,HuD差异表达提供了基因组和机制方面的见解。这些脉络膜转录组的特征阐明了免疫激活,组织功能弹性和CSF代谢稳态。 BCSFB在神经退行性疾病中经历有害但重要的功能和适应性变化;因此,当被神经退行性病理生理学损害时,丰富的JAK-STAT和mTOR途径可能分别帮助CP进行适应性转录以及上皮修复和/或置换。我们预期这些精确的CP翻译数据将有助于药物/转基因疗法减轻痴呆。

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