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首页> 外文期刊>Standards in Genomic Sciences >Complete genome sequence of thermophilic Bacillus smithii type strain DSM 4216 T
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Complete genome sequence of thermophilic Bacillus smithii type strain DSM 4216 T

机译：嗜热芽孢杆菌型菌株DSM 4216 T的完整基因组序列

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Bacillus smithii is a facultatively anaerobic, thermophilic bacterium able to use a variety of sugars that can be derived from lignocellulosic feedstocks. Being genetically accessible, it is a potential new host for biotechnological production of green chemicals from renewable resources. We determined the complete genomic sequence of the B. smithii type strain DSM 4216supT/sup, which consists of a 3,368,778?bp chromosome (GenBank accession number CP012024.1) and a 12,514?bp plasmid (GenBank accession number CP012025.1), together encoding 3880 genes. Genome annotation via RAST was complemented by a protein domain analysis. Some unique features of B. smithii central metabolism in comparison to related organisms included the lack of a standard acetate production pathway with no apparent pyruvate formate lyase, phosphotransacetylase, and acetate kinase genes, while acetate was the second fermentation product.
机译：史密斯芽孢杆菌是一种兼性厌氧，嗜热细菌，能够使用多种可得自木质纤维素原料的糖。由于可遗传获取，因此它是利用可再生资源生物技术生产绿色化学品的潜在新宿主。我们确定了B. smithii型菌株DSM 4216 T 的完整基因组序列，该菌株由3,368,778？bp染色体（GenBank登录号CP012024.1）和12,514？bp质粒（GenBank登录号）组成。 CP012025.1），共同编码3880个基因。通过RAST进行的基因组注释得到了蛋白质结构域分析的补充。与相关生物相比，史密斯芽孢杆菌中央代谢的一些独特特征包括缺乏标准的乙酸生产途径，没有明显的丙酮酸甲酸裂解酶，磷酸转乙酰酶和乙酸激酶基因，而乙酸是第二种发酵产物。

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