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Genetic diversity among varieties of the native forage grass Trichloris crinita based on AFLP markers, morphological characters, and quantitative agronomic traits

机译：基于AFLP标记，形态特征和定量农艺性状的天然牧草Trichloris crinita品种间的遗传多样性

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We assessed the genetic diversity in Trichloris crinita (Poaceae) varieties from South America, using AFLPs, morphological characters, and quantitative agronomic traits. Owing to the importance of this species for range grazing, we first characterized the varieties based on forage productivity. Biomass production varied 9 fold among the materials evaluated. Analysis of AFLP fingerprints allowed the discrimination of all varieties with a few selected primer combinations. Pair-wise genetic similarities, using marker data, ranged from 0.31 to 0.92 (Jaccard coefficients). Marker-based unweighted pair group method with arithmetic averaging (UPGMA) cluster analysis did not show geographical clustering, but rather grouped the varieties according to their biomass production. We identified 18 markers associated with biomass production, of which 8 showed complete correlation (r = 1.00) with this trait. These DNA markers can be used to assist selection for high forage productivity in T. crinita. Cluster analysis using morphological and quantitative characters revealed 4 distinct groups of varieties, clearly separated according to their biomass yield. The variables foliage height and basal diameter were strongly correlated with biomass production and these phenotypic markers can be used to select productive plants. The relations among the varieties based on AFLP data were significantly correlated with those based on agronomic and morphological characters, suggesting that the 2 systems give similar estimates of genetic relations among the varieties.Key words: AFLP fingerprinting, genetic diversity, Trichloris crinita, morphology, biomass production.Les auteurs ont mesuré la diversité génétique au sein de variétés du Trichloris crinita (hordées) d'Amérique du Sud à l'aide de marqueurs AFLP et de caractères morphologiques ou agronomiques. En raison de l'importance de cette espèce au sein des prairies fourragères, les variétés ont d'abord été caractérisées sur la base de leur productivité en fourrage. La production de biomasse variait par un facteur 9 au sein du matériel évalué. Une analyse des empreintes AFLP a permis de distinguer toutes les variétés à l'aide de quelques paires d'amorces choisies. Les similarités génétiques calculées sur la base des marqueurs variaient entre 0,31 et 0,92 (coefficient de Jaccard). Une analyse de groupement UPGMA, fondée sur les marqueurs, n'a pas montré de groupement sur des bases géographiques, mais plutôt en fonction de leur production de biomasse. Les auteurs ont identifié 18 marqueurs associés à la production de biomasse dont huit montraient une corrélation parfaite (r = 1,00) avec ce caractère. Ces marqueurs moléculaires pourront servir en sélection assistée pour une productivité fourragère élevée chez le T. crinita. Une analyse de groupement sur la base des données morphologiques et agronomiques a révélé quatre groupes distincts de variétés, clairement séparés en fonction de leur rendement en biomasse. La hauteur du feuillage et le diamètre basal sont deux variables qui étaient fortement corrélées avec la production de biomasse et ces marqueurs phénotypiques peuvent servir à la sélection de plantes productives. Les relations entre les variétés sur la base des données AFLP étaient significativement corrélées avec celles fondées sur les données agronomiques et morphologiques. Ceci suggère que les deux systèmes fournissent des estimés semblables des relations génétiques entre variétés.Mots clés : empreintes AFLP, diversité génétique, Trichloris crinita, morphologie, production de biomasse.[Traduit par la Rédaction]
机译：我们使用AFLP，形态学特征和定量农艺性状评估了来自南美的Trichloris crinita（禾本科）品种的遗传多样性。由于该物种对于放牧的重要性，我们首先根据牧草生产力对这些品种进行了表征。在所评估的材料中，生物质的产量变化了9倍。 AFLP指纹图谱的分析允许使用几种选定的引物组合来区分所有品种。使用标记数据的成对遗传相似性介于0.31至0.92（雅卡德系数）之间。基于标记的具有算术平均（UPGMA）聚类分析的非加权对分组方法没有显示地理聚类，而是根据品种的生物量产量对其进行了分组。我们确定了18个与生物量生产相关的标记，其中8个显示出与该性状完全相关（r = 1.00）。这些DNA标记可用于协助选择T. crinita的高牧草生产力。使用形态和数量特征进行的聚类分析揭示了4个不同的品种组，根据它们的生物量产量将它们清楚地分开。叶子的高度和基部直径的变化与生物量的产生密切相关，这些表型标记可用于选择生产性植物。基于AFLP数据的品种间关系与基于农艺学和形态学特征的关系之间存在显着相关性，这表明这两个系统对品种之间的遗传关系进行了相似的估计。关键词：AFLP指纹图谱，遗传多样性，Trichloris crinita，形态，农业生物多样性生产的三叶草（Trichloris crinita）的变种的继任者（AF）以及农艺学上的形态特征和特征。富裕的法国大草原地区的重要奶酪生产企业，在法国的生产基础上具有多种特色。 9 au sein dumatérielévalué的生物多样性生产商杂志。联合国女企业家协会（AFLP）分析了各式各样的休闲服装，他们选择了各式各样的休闲服装。同类大律师的变种总成本为0.31和0.92（雅卡德系数）。 UPGMA集团的分析，大马国的丰业集团，基础生物集团的蒙特普勒集团，生物质生产的主要企业。 Les auteurs Ontidentifyé18 marqueursassociésàla production de bione e dont huit montraient uni corcorlation parfaite（r = 1,00）avec cecaractère。 Ces marqueursmoléculairespourront servir ensélectionéééééçééédecééééééééééédecérééde lacéré。根据形态和农学基础上的分类法，对不同种类的，不同种类的保护性生物质种进行分类。法定产区和产区的变量，以提高生物质生产能力和变种能力为目的的变种。法国农牧业企业之间的关系以及农作物农艺学和形态学上的重要性。 Cecisuggèreque les deuxsystèmes总体评价和各种关系的分类。主题：AFLP的代表，多样化的génétique，Trichloris crinita，morphologie和parédéde la deéde la dedédédénédédédénéé

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